代码示例

让我们使用加仑公里数这个数据集,格式如下:

我会通过汽车的以下属性来判断它的加仑公里数:汽缸数、排气量、马力、重量、加速度。我将392条数据都存放在mpgData.txt文件中,并用下面这段Python代码将这些数据按层次等分成十份:

# -*- coding: utf-8 -*-
# 
# 将数据等分成十份的示例代码

import random

def buckets(filename, bucketName, separator, classColumn):
    """filename是源文件名
    bucketName是十个目标文件的前缀名
    separator是分隔符,如制表符、逗号等
    classColumn是表示数据所属分类的那一列的序号"""

    # 将数据分为10份
    numberOfBuckets = 10
    data = {}
    # 读取数据,并按分类放置
    with open(filename) as f:
        lines = f.readlines()
    for line in lines:
        if separator != '\t':
            line = line.replace(separator, '\t')
        # 获取分类
        category = line.split()[classColumn]
        data.setdefault(category, [])
        data[category].append(line)
    # 初始化分桶
    buckets = []
    for i in range(numberOfBuckets):
        buckets.append([])       
    # 将各个类别的数据均匀地放置到桶中
    for k in data.keys():
        # 打乱分类顺序
        random.shuffle(data[k])
        bNum = 0
        # 分桶
        for item in data[k]:
            buckets[bNum].append(item)
            bNum = (bNum + 1) % numberOfBuckets

    # 写入文件
    for bNum in range(numberOfBuckets):
        f = open("%s-%02i" % (bucketName, bNum + 1), 'w')
        for item in buckets[bNum]:
            f.write(item)
        f.close()

# 调用示例      
buckets("pimaSmall.txt", 'pimaSmall',',',8)

执行这个程序后会生成10个文件:mpgData01、mpgData02等。

编程实践

你能否修改上一章的近邻算法程序,让test函数能够执行十折交叉验证?输出的结果应该是这样的:

解决方案

我们需要进行以下几步:

  • 修改初始化方法,只读取九个桶中的数据作为训练集;
  • 增加一个方法,从第十个桶中读取测试集;
  • 执行十折交叉验证。

下面我们分步来看:

  • 初始化方法__init__

__init__方法的签名会修改成以下形式:

def __init__(self, bucketPrefix, testBucketNumber, dataFormat):

每个桶的文件名是mpgData-01、mpgData-02这样的形式,所以bucketPrefix就是“mpgData”。testBucketNumber是测试集所用的桶,如果是3,则分类器会使用1、2、4-9的桶进行训练。dataFormat用来指定数据集的格式,如:

class    num    num    num    num    num    comment

意味着第一列是所属分类,后五列是特征值,最后一列是备注信息。

以下是初始化方法的示例代码:

class Classifier:

    def __init__(self, bucketPrefix, testBucketNumber, dataFormat):
        """该分类器程序将从bucketPrefix指定的一系列文件中读取数据,
        并留出testBucketNumber指定的桶来做测试集,其余的做训练集。
        dataFormat用来表示数据的格式,如:
        "class    num    num    num    num    num    comment"
        """

        self.medianAndDeviation = []

        # 从文件中读取文件

        self.format = dataFormat.strip().split('\t')
        self.data = []
        # 用1-10来标记桶
        for i in range(1, 11):
            # 判断该桶是否包含在训练集中
            if i != testBucketNumber:
                filename = "%s-%02i" % (bucketPrefix, i)
                f = open(filename)
                lines = f.readlines()
                f.close()
                for line in lines[1:]:
                    fields = line.strip().split('\t')
                    ignore = []
                    vector = []
                    for i in range(len(fields)):
                        if self.format[i] == 'num':
                            vector.append(float(fields[i]))
                        elif self.format[i] == 'comment':
                            ignore.append(fields[i])
                        elif self.format[i] == 'class':
                            classification = fields[i]
                    self.data.append((classification, vector, ignore))
        self.rawData = list(self.data)
        # 获取特征向量的长度
        self.vlen = len(self.data[0][1])
        # 标准化数据
        for i in range(self.vlen):
            self.normalizeColumn(i)
  • testBucket方法

下面的方法会使用一个桶的数据进行测试:

def testBucket(self, bucketPrefix, bucketNumber):
    """读取bucketPrefix-bucketNumber所指定的文件作为测试集"""

    filename = "%s-%02i" % (bucketPrefix, bucketNumber)
    f = open(filename)
    lines = f.readlines()
    totals = {}
    f.close()
    for line in lines:
        data = line.strip().split('\t')
        vector = []
        classInColumn = -1
        for i in range(len(self.format)):
              if self.format[i] == 'num':
                  vector.append(float(data[i]))
              elif self.format[i] == 'class':
                  classInColumn = i
        theRealClass = data[classInColumn]
        classifiedAs = self.classify(vector)
        totals.setdefault(theRealClass, {})
        totals[theRealClass].setdefault(classifiedAs, 0)
        totals[theRealClass][classifiedAs] += 1
    return totals

比如说bucketPrefix是mpgData,bucketNumber是3,那么程序会从mpgData-03中读取内容,作为测试集。这个方法会返回如下形式的结果:

{'35': {'35': 1, '20': 1, '30': 1},
 '40': {'30': 1},
 '30': {'35': 3, '30': 1, '45': 1, '25': 1},
 '15': {'20': 3, '15': 4, '10': 1},
 '10': {'15': 1},
 '20': {'15': 2, '20': 4, '30': 2, '25': 1},
 '25': {'30': 5, '25': 3}}

这个字段的键表示真实类别。如第一行的35表示该行数据的真实类别是35加仑公里。这个键又对应一个字典,这个字典表示的是分类器所判断的类别,如:

'15': {'20': 3, '15': 4, '10': 1},

其中的3表示有3条记录真实类别是15加仑公里,但被分类到了20加仑公里;4表示分类正确的记录数;1表示被分到10加仑公里的记录数。

  • 执行十折交叉验证

最后我们需要编写一段程序来执行十折交叉验证,也就是说要用不同的训练集和测试集来构建10个分类器。

def tenfold(bucketPrefix, dataFormat):
    results = {}
    for i in range(1, 11):
        c = Classifier(bucketPrefix, i, dataFormat)
        t = c.testBucket(bucketPrefix, i)
        for (key, value) in t.items():
            results.setdefault(key, {})
            for (ckey, cvalue) in value.items():
                results[key].setdefault(ckey, 0)
                results[key][ckey] += cvalue

    # 输出结果
    categories = list(results.keys())
    categories.sort()
    print(   "\n       Classified as: ")
    header =    "        "
    subheader = "      +"
    for category in categories:
        header += category + "   "
        subheader += "----+"
    print (header)
    print (subheader)
    total = 0.0
    correct = 0.0
    for category in categories:
        row = category + "    |"
        for c2 in categories:
            if c2 in results[category]:
                count = results[category][c2]
            else:
                count = 0
            row += " %2i |" % count
            total += count
            if c2 == category:
                correct += count
        print(row)
    print(subheader)
    print("\n%5.3f percent correct" %((correct * 100) / total))
    print("total of %i instances" % total)

# 调用方法
tenfold("mpgData/mpgData", "class num num num num num comment")

执行结果如下:

       Classified as: 
        10   15   20   25   30   35   40   45   
      +----+----+----+----+----+----+----+----+
10    |  3 | 10 |  0 |  0 |  0 |  0 |  0 |  0 |
15    |  3 | 68 | 14 |  1 |  0 |  0 |  0 |  0 |
20    |  0 | 14 | 66 |  9 |  5 |  1 |  1 |  0 |
25    |  0 |  1 | 14 | 35 | 21 |  6 |  1 |  1 |
30    |  0 |  1 |  3 | 17 | 21 | 14 |  5 |  2 |
35    |  0 |  0 |  2 |  8 |  9 | 14 |  4 |  1 |
40    |  0 |  0 |  1 |  0 |  5 |  5 |  0 |  0 |
45    |  0 |  0 |  0 |  2 |  1 |  1 |  0 |  2 |
      +----+----+----+----+----+----+----+----+

53.316 percent correct
total of 392 instances

可以在这里下载代码数据集

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